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Avanzando en el descubrimiento de medicamentos con HPC Cloud

Hola otra vez. Yo soy Simón Sánchez y en esta ocasión vamos a hablar sobre Avanzando en el descubrimiento de medicamentos con HPC Cloud

Para desarrollar un nuevo medicamento, la compañía farmacéutica promedio gasta alrededor de mil millones de dólares en diez años. Esta es una situación insostenible para quienes padecen enfermedades graves y no tienen el lujo del tiempo. Es por eso que la informática de alto rendimiento, que se ha demostrado que acelera drásticamente el ritmo de los descubrimientos, es tan fundamental para el dominio de la biomedicina.

Los Institutos Novartis para la Investigación Biomédica es una de las empresas de biociencia que comprende los beneficios de utilizar HPC en la lucha contra enfermedades como el cáncer. En una presentación en la Cumbre AWS 2014 en Nueva York hoy, Novartis detalló cómo usó la nube de Amazon para identificar compuestos farmacológicos prometedores.

La compañía confió en el software AWS EC2 y Cycle Computing para construir y acceder a una supercomputadora de $ 44 millones por solo $ 5,000. En solo 11 horas, los investigadores de Novartis tenían tres compuestos anticancerígenos potenciales para realizar más ensayos.

Toda la colaboración fue facilitada por Cycle Computing como lo describe Brad Rutledge de Cycle en un reciente Entrada de blog.

Para evaluar mejor las proteínas objetivo específicas asociadas con ciertos cánceres, los investigadores de Novartis utilizaron el software en la nube de Cycle en conjunto con la nube EC2 de Amazon, lo que les permitió iniciar una supercomputadora masiva en un tiempo récord y con un costo inicial bajo. . En términos de software específico, Novartis confió en CycleSever para la ubicación de la carga de trabajo, CycleCloud para orquestar los entornos HPC en la infraestructura de Amazon, Chef 11 Server para la configuración continua de instancias y HTCondor para la programación de trabajos.

En 11 horas, el equipo completó el equivalente a 39 años de diseño de fármacos a un costo de $ 4.232. Durante ese tiempo, Novartis analizó 10 millones de compuestos e identificó tres candidatos prometedores, que fueron promovidos a las siguientes etapas del diseño de fármacos, lo que acercó a la empresa mucho más a un fármaco contra el cáncer que salva vidas.

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