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En tu cartel, prepárate, aprieta

Hola de nuevo. Te habla Simón Sánchez y esta vez te voy a hablar sobre En tu cartel, prepárate, aprieta

Los enfoques de secuenciación del ADN son muy prometedores para la sociedad. La investigación de hoy se convertirá en las poderosas herramientas diagnósticas y terapéuticas del mañana. En una era en la que los investigadores buscan cada vez más ADN para descubrir los secretos de la enfermedad, muchos centros de secuenciación de ADN buscan la computación en la nube como una forma de manejar cargas de trabajo intensivas en datos. De hecho, los volúmenes de datos son tan grandes que las técnicas de compresión actuales son insuficientes. Aquí es donde entra en juego el concurso Sequence Squeeze. Pistoia Alliance está ofreciendo $ 15,000 por el mejor algoritmo de compresión NGS de código abierto presentado antes de la fecha de cierre del 15 de marzo de 2012.

La competencia en sí es una buena demostración de cómo los recursos de computación en la nube pueden respaldar el campo de la investigación del ADN. En un correo electrónico, el coordinador de la competencia Richard Holland explicó que la competencia está alojada en servidores de Amazon y requiere que los participantes ingresen sus soluciones empaquetadas como buckets de Amazon S3. Esto significa que se requiere una cuenta de Amazon para iniciar sesión, pero Amazon Web Services ofrece un período de prueba gratuito, que según Holland debería ser suficiente para la mayoría de las soluciones. Las entradas luego se descomprimirán y ejecutarán en una máquina de prueba alojada en Amazon. Las primeras 40 entradas al evento recibirán cupones de AWS de $ 20.

El ilustre jurado se basa en los centros de secuenciación más reconocidos del mundo: el Wellcome Trust Sanger Institute en Cambridge, Inglaterra; el Instituto de Genómica de Beijing en China; y el Broad Institute de Estados Unidos.

Para obtener más información, visite el concurso Sequence Squeeze sitio web.

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