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GRID OFRECERÁ MÁS INFORMACIÓN PARA BIOMEDICINA EN TEXAS

Hola, un placer verte por aquí. Soy Simón Sánchez y en esta ocasión vamos a hablar sobre GRID OFRECERÁ MÁS INFORMACIÓN PARA BIOMEDICINA EN TEXAS

Los investigadores biomédicos de Texas pronto podrán utilizar los mejores recursos informáticos de Texas, según un acuerdo firmado entre el Centro Médico de la Universidad de Texas Southwestern en Dallas (UT Southwestern) y el Centro de Computación Avanzada de Texas (TACC) en la universidad. de Texas (UT).

El acuerdo es un primer paso para unir a los investigadores médicos de clase mundial del Sistema de la Universidad de Texas con recursos informáticos y de visualización de clase mundial que también son parte del sistema pero que no se encuentran en ubicaciones médicas. La computación en red hace posible el matrimonio. «Este acuerdo ayudará a los componentes de investigación biomédica en el sistema de UT a utilizar los recursos y la experiencia de UT Austin para resolver problemas importantes de investigación médica», dijo Juan M. Sánchez, vicepresidente de investigación de UT.

«Esperamos colaborar en una serie de áreas de investigación importantes», dijo Kirk A. Kirksey, vicepresidente de recursos de información de UT Southwestern. «La informática que conduzca a nuevas biomedicinas, la comprensión de los sistemas biológicos complejos en muchos niveles y el intercambio y la mejora de las bases de datos bioinformáticas estarán entre los objetivos principales».

Según el acuerdo, TACC brindará a los investigadores de UT Southwestern acceso directo a recursos informáticos de alta gama en TACC. Estos incluyen Lonestar, la supercomputadora más poderosa para la investigación académica en Texas y uno de los sistemas más poderosos del mundo, y Maverick, un sistema de visualización de memoria compartida grande único en su tipo. TACC también capacitará o consultará a investigadores de UT Southwestern para ayudarlos a usar sistemas de alta gama de manera más eficiente. Los 2 petabytes de almacenamiento fuera de línea de TACC combinados con una red de almacenamiento de 50 terabytes permitirán la creación de bases de datos a gran escala, el intercambio y la federación de información biomédica y de imágenes.

Todos los recursos de TACC estarán disponibles a través de conexiones de red de alta velocidad que finalmente integrarán a los investigadores de UT Southwestern y sus recursos con una infraestructura computacional nacional porque TACC es uno de los nueve socios de TeraGrid, la principal red de investigación nacional de National Science. Fundación. «Esta asociación con UT Southwestern permitirá a los investigadores biomédicos de clase mundial y especialistas en procesamiento avanzado trabajar juntos hacia descubrimientos que mejoren la calidad de vida humana», dijo Jay Boisseau, director de TACC.

UT Southwestern y la importancia de la biocomputación

UT Southwestern Medical Center en Dallas es una de las escuelas de medicina líderes en el mundo, con centros de investigación clínica y de laboratorio y un importante hospital de investigación. La distinguida facultad incluye cuatro premios Nobel activos, 15 miembros de la Academia Nacional de Ciencias y 10 investigadores del Instituto Médico Howard Hughes. Una de las ganadoras del Premio Nobel de Fisiología o Medicina de este año, Linda Buck del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson en Seattle, se graduó de UT Southwestern.

UT Southwestern recientemente amplió sus actividades de biocomputación. Una subvención de los NIH otorgada en octubre a la división de TI de Northrop Grumman Corporation incluye fondos para dos iniciativas de biocomputación en UT Southwestern, que se centran en enfermedades infecciosas y trastornos inmunitarios, respectivamente. «Somos muy conscientes de que se puede hacer más en todos los frentes», dijo Kirksey, «y el acuerdo para trabajar con TACC abre un mundo de oportunidades en bioinformática y computación biomédica».

El cálculo juega un papel a todas las escalas en la investigación biológica, desde la investigación atómica y molecular hasta la de tejidos y órganos. “Los datos sobre secuencias de genes, estructuras de proteínas, vías metabólicas y redes de señalización celular están ahora disponibles en tal cantidad que podemos estudiar la dinámica de estos complejos sistemas de forma rigurosa y cuantitativa. Esto significa informática. Lo que aprendemos es fascinante en sí mismo y también es la fuente de la invención «, dijo Elliott M. Ross, profesor de farmacología en UT Southwestern. Ross es el profesor distinguido John P. Perkins de ciencia biomédica y posee los títulos Greer Garson y EE. Cátedra Distinguida Fogelson de Investigación Médica. «Nuestro grupo y muchos otros aquí podrán abordar problemas importantes pero previamente inaccesibles utilizando las habilidades y recursos de TACC y resolver problemas anteriormente difíciles de manera más rápida y sencilla».

TACC y UT Southwestern explorarán el uso de tecnologías de computación en red utilizadas en NSF TeraGrid y tecnologías desarrolladas con IBM para el proyecto UT Grid en todo el campus. «Aprovecharemos las tecnologías de cuadrícula para la visualización remota y colaborativa, implementaremos portales web para aplicaciones de biociencia y permitiremos a los investigadores de UT Southwestern lanzar trabajos de computación de alto rendimiento de todo tipo para ejecutar en TACC, directamente desde sus sistemas de escritorio». Dijo Boisseau. «TACC busca permitir el descubrimiento científico en todas las disciplinas a través del procesamiento avanzado, y nos apasionan particularmente los avances que mejoran la salud y el bienestar humanos».

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