Los modelos informáticos hacen avanzar la investigación sobre la influenza - Calendae | Informática, Electrónica, CMS, Ciberseguridad

Los modelos informáticos hacen avanzar la investigación sobre la influenza

Hola y mil gracias por leerme. En el teclado Simón Sánchez y hoy te voy a hablar sobre Los modelos informáticos hacen avanzar la investigación sobre la influenza

Un equipo de científicos del Centro de Computación de Investigación de la Universidad de Chicago, el Centro de Computación Avanzada de Texas en la Universidad de Texas en Austin, el Centro de Supercomputación de San Diego en la Universidad de San Diego y el Centro de Computación de Alto Rendimiento del Departamento de Defensa de Vicksburg , Miss., Están usando algunas de las supercomputadoras más poderosas del país para estudiar la replicación del virus de la influenza.

El principal tratamiento para la influenza A es la amantadina. El fármaco es un compuesto orgánico que bloquea el flujo de protones a través del canal M2, uno de los principales objetivos de las terapias antivirales. Desafortunadamente, el tratamiento se está volviendo menos efectivo debido a la evolución viral. Las mutaciones en el virus de la influenza cambiaron la capacidad de la amantadina para unirse a la proteína M2. Actualmente, existe un gran impulso para identificar compuestos más efectivos para bloquear las proteínas de la gripe y ayudar a proteger contra pandemias mortales.

Para simular el complejo proceso de transferencia de protones a través del canal M2, el equipo de investigación solicitó cuatro sistemas informáticos de alto rendimiento: el grupo informático de alto rendimiento Midway en el Centro de Informática de Investigación de la Universidad, así como recursos de Texas Advanced. Centro de Computación en la Universidad de Texas en Austin, el Centro de Supercomputación de San Diego en la Universidad de San Diego y el Centro de Computación de Alto Rendimiento del Departamento de Defensa en Vicksburg, Mississippi.

La potencia combinada de HPC facilitó las simulaciones multiescala con un detalle sin precedentes. Los resultados validan el vínculo entre las mutaciones de la proteína M2 y la resistencia a los medicamentos, una conexión que se había demostrado en experimentos pero que no se había descrito computacionalmente hasta ahora. Este es un gran avance que ha estado en marcha durante dos décadas, ya que es el tiempo que los científicos y diseñadores de medicamentos han estado luchando por comprender las complejidades del canal M2.

«La simulación por computadora, cuando se hace muy bien, con toda la física correcta, revela una gran cantidad de información que de otro modo no obtendría», relaciones uno de los investigadores principales, Gregory Voth, Profesor Haig P. Papazian de Química de Servicios Distinguidos. «En principio, podría hacer estos cálculos con posibles dianas de fármacos y ver cómo se unen y si son realmente efectivos».

La deconstrucción del flujo de protones y el papel del canal M2 permitirán a los científicos predecir la eficacia de posibles objetivos farmacológicos. El equipo ahora se está preparando para acelerar la simulación y explicar los efectos de las mutaciones resistentes a los medicamentos. También planean expandir su estudio a otras formas de influenza, como la influenza B, que tiene un canal M2 diferente y es completamente resistente a la amantadina.

Un artículo que describe la investigación aparece en Proceedings of the National Academy of Sciences Online Early Edition de la semana del 16 al 20 de junio de 2014. Fue escrito por Ruibin Liang, un estudiante graduado en química en UChicago, y tres co-

Puedes compartir en tu Facebook para que tus amigos lo lean

??? ? ? ???

Comparte