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NERSC revela 44 equipos de código NESAP

Hola de nuevo. Te escribe Simón Sánchez y hoy vamos a hablar sobre NERSC revela 44 equipos de código NESAP

El mes pasado, el Centro Nacional de Computación Científica de Investigación Energética (NERSC) anunció una colaboración con los proveedores de supercomputadoras Intel y Cray para prepararse para Cori, la supercomputadora Cray XC que se espera que se implemente en NERSC en 2016. Para garantizar las cargas de trabajo La comunidad científica altamente diversa del DOE continúa recibiendo apoyo a medida que más de 5,000 usuarios hacen la transición a Cori, los socios han lanzado el Programa de Aplicaciones Científicas Exascale NERSC (NESAP).

Como parte de este esfuerzo, el NERSC había lanzado previamente una convocatoria de propuestas para el programa de optimización de código. De 50 propuestas, el NERSC redujo el grupo a 20, que compartió públicamente la semana pasada. Durante la aceptación del sistema Cori, NESAP conectará estos 20 equipos de aplicaciones con recursos de NERSC, Cray e Intel. Los equipos tendrán acceso a hardware inicial, capacitación especial y sesiones de preparación con el personal de Intel y Cray.

“Quedamos muy impresionados con la respuesta a nuestra invitación a participar: recibimos 50 propuestas”, Ella dijo Harvey Wasserman, consultor de HPC en NERSC y director postdoctoral de NESAP. “NERSC está muy agradecido por la participación de los usuarios; ellos harán el «trabajo pesado» en el proyecto y nos ayudarán a garantizar que la carga de trabajo esté lista cuando se despliegue Cori. A esta apasionante arquitectura de máquinas le sigue ahora una apasionante ciencia de interés nacional «.

Además de los 20 equipos, también se incluirán en el programa otros 24 equipos de código científico, que se beneficiarán de una formación especializada y un acceso temprano al hardware. El objetivo de NESAP es que los 44 proyectos aprovechen Cori a medida que esté disponible.

El proceso de revisión fue realizado por el NERSC y otro personal del DOE. Los proyectos abarcan una amplia gama de disciplinas de NERSC, que incluyen astrofísica, genómica, ciencia de materiales, modelos climáticos y meteorológicos, física de fusión de plasma y ciencia de aceleradores. La tarea principal será dar forma a los códigos para aprovechar la arquitectura de muchos núcleos de Cori’s Knights Landing, de modo que puedan permitir importantes avances científicos. Por lo tanto, el acceso temprano a prototipos y hardware de producción es un componente crucial de NESAP.

Cómo Anunciado de NERSC, los 20 proyectos aparecen a continuación en relación con la oficina del programa correspondiente.

Investigación en Computación Científica Avanzada (ASCR):

  • Optimización del marco de refinamiento de malla adaptable BoxLib para códigos de aplicación científica, PI: Ann Almgren (Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)
  • CFD de alta resolución y transporte en geometrías complejas con Chombo-Crunch, David Trebotich (Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)

Investigación biológica y ambiental (BER)

  • CESM Global Climate Modeling, John Dennis (Centro Nacional de Investigación Atmosférica)
  • Simulación climática global acoplada de alta resolución utilizando el modelo climático acelerado para la energía (ACME), Hans Johansen (Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)
  • Simulación oceánica multiescala para el estudio del cambio climático global y regional, Todd Ringler (Laboratorio Nacional de Los Alamos)
  • Simulación de dinámica molecular (MD) de Gromacs para bioenergía y biociencias ambientales, Jeremy C. Smith (Laboratorio Nacional de Oak Ridge)
  • Meraculous, un ensamblador de genoma de producción de novo para problemas genómicos relacionados con la energía, Katherine Yelick (Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)

Ciencias Energéticas Básicas (BES):

  • Simulaciones moleculares a gran escala con NWChem, PI: Eric Jon Bylaska (Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico)
  • Parsec: una herramienta computacional escalable para el descubrimiento y diseño de fenómenos estatales emocionados en materiales energéticos, James Chelikowsky (Universidad de Texas, Austin)
  • BerkeleyGW: Cuasipartícula masivamente paralela y cálculo de propiedades ópticas para materiales y nanoestructuras (Jack Deslippe, NERSC)
  • Ciencia de los materiales con Quantum Espresso, Paul Kent (Laboratorio Nacional Oak Ridge)
  • Modelado geofísico inverso 3D a gran escala de la Tierra, Greg Newman (Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)

Ciencias de la energía de fusión (FES)

  • Comprensión de la física de Fusion Edge mediante el código girocinético global XGC1, Choong-Seock Chang (Laboratorio de física del plasma de Princeton)
  • Abordar la magnetohidrodinámica del plasma de fusión no ideal utilizando M3D-C1, Stephen Jardin (Laboratorio de Física del Plasma de Princeton)

Física de altas energías (HEP)

  • HACC (Código de cosmología acelerada por hardware / híbrido) para cosmología de escala extrema, Salman Habib (Laboratorio nacional de Argonne)
  • El conjunto de códigos MILC para simulación y análisis de cromodinámica cuántica (QCD), Doug Toussaint (Universidad de Arizona)
  • Modelado avanzado de aceleradores de partículas, Jean-Luc Vay, Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley)

Física nuclear (NP)

  • Fermiones de pared de dominio y quarks escalonados altamente mejorados para Lattice QCD, Norman Christ (Universidad de Columbia) y Frithjof Karsch (Brookhaven National Laboratory)
  • Chroma Lattice QCD Code Suite, Balint Joo (instalación de Jefferson National Accelerator)
  • Estados débilmente ligados y resonantes en cadenas de isótopos ligeros utilizando MFDn – Many Fermion Dynamics Nuclear Physics, James Vary y Pieter Maris (Iowa State University

Los 24 códigos adicionales a los que se dirigirá se enumeran a continuación junto con sus investigadores principales.

GTC-P (Stephane Ethier / PPPL)
GTS (William Tang / PPPL)
VORPAL (John Cary / TechX)
TOSTADA (Julian Borrill / LBNL)
Qbox /[email protected] (Yosuke Kanai / U. Carolina del Norte)
CALCLENS y ROCKSTAR (Risa Wechsler / Stanford)
OESTE (Marco Govoni / U. Chicago)
QLUA (William Detmold / MIT)
P3D (James Drake / U. Maryland)
WRF (John Michalakes / ANL)
PHOSIM (Andrew Connolly / U. Washington)
Instrumentos SDAV (Hank Childs / U. Oregon)
M3D / M3D-K (Linda Sugiyama / MIT)
DGDFT (Lin Lin / UC Berkeley)
GIZMO / GADGET (Joel Primack / UC Santa Cruz)
ZELMANI (Christian Ott / Caltech)
VASP (Martijn Marsman / U. Viena)
NAMD (James Phillips / U. Illinois)
PHOENIX-3D (Eddie Baron / U. Oklahoma)
ACE3P (Cho-Kuen Ng / SLAC)
S3D (Jacqueline Chen / SNL)
ATLAS (Paolo Calafiura / LBNL)
Herramientas de BBTools Genomics (Jon Rood / LBNL, JGI)
DOE MiniApp (Alice Koniges, LBNL)

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