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Puerta de entrada a la ciencia abierta

Hola, ¿qué tal colega?. Te habla Simón Sánchez y en esta ocasión te voy a contar sobre Puerta de entrada a la ciencia abierta

“La ciencia está realmente madura para la revolución. Muchas de las prácticas todavía están muy arraigadas en sus inicios analógicos. “Así es como Kaitlin Thaney, directora del Mozilla Science Lab, una nueva iniciativa de ciencia abierta centrada en la innovación, las mejores prácticas y la capacitación en habilidades de investigación, comenzó su discurso plenario en XSEDE13 en San Diego el mes pasado.

Thaney cree que la web ha transformado radicalmente la forma en que cuestionamos, cómo interactuamos con el contenido, cómo descubrimos la información, nuestros entornos de trabajo y nuestra agilidad. «En Mozilla nos estamos centrando en cómo podemos ayudar a los investigadores a utilizar el poder de la web abierta para cambiar el futuro de la ciencia», dijo.

Mozilla Science Lab está financiado por Alfred P. Loan Foundation, un importante patrocinador de becas de tecnología de la información y digitales con proyectos centrados en el intercambio de datos, nuevas formas de métricas de investigación académica y otras tecnologías del lado de la biblioteca. Thaney ve esto como un juego más grande para ver cómo todos ellos pueden trabajar juntos hacia un medio más amplio de coordinar estos diversos esfuerzos para proporcionar infraestructura e incluso liderazgo en el espacio de ciencia abierta a medida que empuja esta práctica a la corriente principal.

Thaney sostiene que nuestros sistemas actuales todavía están diseñados para crear fricciones a pesar de sus intenciones originales. «Los descubrimientos modernos todavía están encerrados en varios silos y no tan interconectados como podrían estar», dijo. “Incluso considerando cómo recompensamos los aportes científicos, sigue siendo muy dependiente de un sistema de papel. Estamos empezando a ver cuáles serán los efectos en el comportamiento de este tipo de sistema de recompensa, y lo que estamos viendo es más errores en la forma en que se realiza la investigación «.

Citando a Elizabeth Iorns, cofundadora de Science Exchange, Thaney dijo que «hasta el 70 por ciento de la investigación de laboratorio académica no se puede reproducir, lo que es una gran pérdida de dinero y esfuerzo». Señaló que esta estadística refleja un problema más amplio que la comunidad de investigadores debería abordar desarrollando una mejor manera de reflejar y recompensar las contribuciones y prácticas de investigación. «Realmente nos está impidiendo la idea de construir sobre conocimientos adicionales, o conocimientos previos, o pararse sobre los hombros de gigantes, y realmente ver cómo podemos comenzar a minimizar no solo la cantidad de error sino también la cantidad de duplicación». Thaney dijo.

Avanzando

Afortunadamente tenemos Internet, que Thaney considera uno de los avances más importantes desde la época de la imprenta; sin embargo, inventar y practicar son dos cosas muy diferentes. «Aunque la Web fue creada por científicos, creo que probablemente todos podamos estar de acuerdo en gran medida en que la Web aún no ha transformado la ciencia de la misma manera que ha transformado la forma en que hacemos negocios o nuestra apariencia. educación ”, dijo Thaney.

El primer paso es la puerta de enlace. No es casualidad que existan puntos en común entre su proyecto en Mozilla y Science Gateways de XSEDE, el tema de XSEDE13. Ambos buscan preparar recursos basados ​​en la web para que los investigadores de ciencia e ingeniería puedan tener un mejor acceso a los datos, la información, el software y el código en los espacios comunitarios Online. Ambos esperan que al hacer que estas herramientas sean más accesibles aumentará el poder detrás del cálculo.

Thaney dijo en su trabajo anterior en la compañía de tecnología Digital Science que estaban examinando tecnologías basadas en aplicaciones que ayudarían a los investigadores a acercarlos un poco más a un mundo de reproducibilidad y mejores prácticas a través de la web. Descubrieron que el trabajo más exitoso fue con herramientas asignadas a una capa omnipresente, donde los usuarios ni siquiera se daban cuenta de que estaban interactuando con una herramienta basada en la web.

Llenar el vacío

Comenzando con los aspectos físicos de la investigación, los ratones de laboratorio, el ADN, las líneas celulares, hay formas de adjuntar huellas dactilares. «Ya sea un número de seguimiento o algún otro medio para atribuirle identidad, la comunidad puede comenzar a integrarlo en los sistemas para que sea un poco más fácil para el próximo investigador que llegue poder reproducirlo y partir de ahí. sin tener que decodificar «, explicó Thaney.

La investigación no es barata, recordó a los asistentes a la conferencia. “Por ejemplo, obtener una proteína de Huntington, que puede costarle $ 400, solo para llevarla a su laboratorio y darse cuenta de que existe un gran problema con la efectividad del uso de varias proteínas y anticuerpos. Y ahora tienes que empezar de nuevo. «

«El Laboratorio de Ciencias de Mozilla está examinando lo que podríamos aprender de la comunidad de código abierto, tanto en términos de cultura como de tecnología», dijo Thaney. Esa comunidad cree que compartir el riesgo y también recompensar al mezclar la participación y el desarrollo internos y externos a menudo lo llevará mucho más lejos hacia su objetivo. «Mirando la idea más amplia de tener innovación no solo para poner sus ideas en un embudo y luego empujarlas a un mundo más grande, sino convertirlo en un proceso mucho más poroso», dijo Thaney.

La misión de Thaney y Mozilla también incluye aumentar la alfabetización digital. Confiar en prácticas autodidactas ad hoc para cerrar la brecha entre lo que espera saber y lo que tiene los recursos para aprender no es escalable, según Thaney. «La cantidad de veces que los investigadores vinieron a mí y me dijeron ‘quería hacer este postdoctorado, pero mi investigador privado me dijo que necesitaba aprender sobre Python junto con una serie de cosas que nunca antes había experimentado. , así que acabo de comprar un libro. «Esta no es la mejor práctica. «

Una forma en que Mozilla Science Lab está aumentando la alfabetización digital es trabajando con un programa llamado Software Carpentry. El programa enseña habilidades computacionales básicas y habilidades digitales a los investigadores para ayudar a proporcionar el trampolín necesario para la ciencia del siglo XXI.

Mide y lucha contra los miedos

Una métrica tradicional para evaluar el impacto de la investigación académica ha sido el número de veces que se cita un artículo; sin embargo, con el uso cada vez mayor de métricas alternativas o «altmetrics», las citas ya no son la única forma de medir el éxito. La cantidad de veces que un artículo ha sido marcado, tuiteado, compartido, blogueado o citado en Wikipedia ahora puede tener la misma importancia. “Los datos son bastante desconcertantes en cierto contexto. Cuando un documento con el que está asociado podría citarse diez veces, los datos podrían reutilizarse 1.500. Es realmente poderoso poder acudir a su prestamista o poder dirigirse a su administrador de búsqueda y decirle que esta es una pieza útil de mi investigación ”, explicó Thaney.

Thaney comprende el miedo que acompaña a la práctica de la ciencia abierta: «Rendir información y abrirla para que cualquiera la use puede ser un poco aterrador, especialmente cuando se necesita mucho tiempo para recopilar esa información, pero el poder de la red, realmente podemos tener la oportunidad. para abrirlo a tantos ojos como sea posible para ver el uso y el impacto más amplios de lo que esa investigación puede ser «.

Anthony Frachioni, participante de XSEDE13, quien ingresará al programa de doctorado en física en la Universidad de Binghamton en Nueva York en el otoño, dijo que si bien está entusiasmado con la perspectiva de un mundo abierto de ciencia e investigación, al final del día todavía vive con miedo. constante que se toma. «¿Qué haces con el crédito y la cortesía?» le preguntó a Thaney.

“Mucho depende del ser humano. La tecnología ha demostrado que tenemos la capacidad de comenzar a hacer que esta información esté disponible, pero cuando se trata de mecanismos de recompensa, debemos comenzar a brindar algún tipo de garantía, porque de lo contrario solo podemos llegar hasta cierto punto «, respondió.» Puedo decir que investigadores que están siendo considerados simplemente porque pusieron a disposición cierta información al principio está sucediendo mucho menos de lo que uno podría pensar, pero entiendo que cuando se trata de seguridad laboral, necesitamos algo mucho más concreto «.

Thaney dijo que la preocupación es por qué Mozilla, a través de un programa separado, está buscando formas de proporcionar insignias, o algún otro tipo de reconocimiento dentro de la universidad o institución del investigador, para mostrar prueba de propiedad intelectual en un área en particular. La esperanza es que tener algo que mostrar para compartir la información brinde consuelo al investigador y advierta a los demás que lo piensen dos veces antes de recopilarla. «No es un problema fácil de resolver, pero estamos trabajando en ello», dijo Thaney.

Incluso sin soluciones concretas, Frachioni sigue entusiasmado con las posibilidades de la ciencia abierta. «Todo esto no tiene precedentes, y eso no nos dará ninguna tranquilidad al final del día», dijo, «pero creo que es nuestra responsabilidad entrar en esto sabiendo eso y sabiendo que debemos hacerlo de todos modos».

La conferencia anual XSEDE, organizada por Extreme Science and Engineering Discovery Environment de la National Science Foundation con el apoyo de patrocinadores corporativos y sin fines de lucro, reúne a la comunidad extendida de personas interesadas en promover la investigación en infraestructura de tecnología de la información y servicios digitales integrados. en beneficio de la ciencia y la sociedad. XSEDE13 se llevó a cabo del 22 al 25 de julio en San Diego; XSEDE14 se llevará a cabo del 13 al 18 de julio en Atlanta. Para más información visite https://conferences.xsede.org/xsede14.

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